Lors de la sortie de WP 2.7, on avait parlé de la publication d’une documentation officielle pour le coeur de WordPress, cette dernière est accessible pour la version de développement à l’adresse :
http://phpdoc.wordpress.org/trunk/
Pour les autres versions, une page du codex décortique les différentes docs disponibles :
http://phpdoc.wordpress.org/trunk/WordPress
À noter que contrairement à un phpXref classique, la documentation de WordPress contient également la doc de toutes les librairies (JS, PHP) utilisées dans le projet.